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ctDNA该怎么玩? 血浆ctDNA多平台EGFR突变检测对比

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1904 4 草船借箭 发表于 2016-1-10 18:43:11 | 查看全部 | 阅读模式 来自: 山东烟台

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本帖最后由 草船借箭 于 2016-1-10 18:44 编辑 % d! {% n$ O% h4 _5 w2 f0 @

/ c& F$ `# ^+ Khttp://mp.weixin.qq.com/s?__biz= ... e=0#wechat_redirect
. C/ f' C' M- T2 J# T$ t4 \' _阿斯利康公司研究团队利用AURA临床试验对患者血浆ctDNA的EGFR突变检测进行数字PCR与传统PCR检测的多平台比较,证明了包括cobas EGFR突变检测、ARMS法、ddPCR、BEAMing dPCR技术在内的多平台是常见EGFR敏感性突变的有力检测手段;cobas法和BEAMing法在血浆T790M的检测上显示出高敏感性(> 70%);T790M异质性可能解释大多数血浆-组织的不一致。该研究结果2015年12月发表在《肺癌》(Lung Cancer)杂志上。' @9 p% Y. W0 [. [/ G6 T
近年研究证明,ctDNA在EGFR突变检测上具有特异性、敏感性、与组织结果一致性,可替代肿瘤组织作为一种可行的、微创的液体活检方法。然而对于ctDNA,虽然有几种方法可用于突变分析,包括数字PCR(dPCR)、突变体富集PCR及肽核酸锁核酸PCR,但缺乏广泛认可的分析方法。一项开放性、多中心,针对EGFR-TKI耐药的晚期非小细胞肺癌患者正在进行的旨在评价AZD9291安全性、耐受性、有效性的I期AURA试验显示出AZD9291的可喜临床疗效(临床试验标识符:NCT01802632),同时该试验比较了多种平台用ctDNA检测EGFR突变(包括T790M耐药突变)的情况,以明确在AZD9291临床应用中使用最合适的检测技术。: ?" _* R' ?; y$ m6 i; ~
研究者们使用多个平台对ctDNA检测了三种常见的EGFR突变(19外显子缺失、L858R和T790M),包括非数字检测系统—COBAS EGFR突变检测(Roche Molecular Systems)、therascreen EGFR扩增阻滞突变系统(ARMS)法(QIAGEN)和数字检测系统—液滴数字PCR (ddPCR)(Bio-Rad/MolecularMD)、BEAMing dPCR技术(Sysmex Inostics)。! h& _) Y. l1 K0 O7 e( F
用以上平台先对38例样本进行初步评估。与组织检测结果相比,对于EGFR-TKI敏感性突变,cobas 法、 ARMS法、BEAMing法、ddPCR法(只针对L858R突变)表现出高敏感度(78%-100%)和高特异性(93%-100%);对于T790M突变,数字平台优于非数字平台(表1)。而且,比起局限于胸内的患者(M1A / M0),T790M突变更容易在胸外转移患者(M1)中检测到(P<  0.01)。
" T# f4 l. L; e7 e表1
- f! C' x# b7 ^) @0 l7 S1452147960783018503.png7 o, c# p) ]3 @& x/ @' ?
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* L7 t7 c3 C; o0 `  N. P) f* W7 K5 ]1 }随后用数字检测的BEAMing法、非数字检测的cobas法追加评估了72例基线血浆样品。对于EGFR-TKI敏感性突变,两个平台均表现出高敏感性(82–87%)和高特异性(97%);对于T790M突变,二者均表现出高敏感性(表2)。BEAMing法的敏感性高(81%)但特异性低(58%)(表2)。两平台之间的一致性大于90%,表明多个平台能够敏感而特异地检测EGFR 敏感性突变。
: ]0 l0 \. U8 `2 ~表20 X$ ~1 p% T2 g% ~" n
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基于T790M耐药突变基线水平(即一线TKI耐药后,服用AZD9291之前)的AZD9291临床反应在血浆和组织中的结果如图1所示。T790M突变阳性患者的临床反应率在血浆和组织中几乎是相同的(59% vs. 61%)。' K7 H1 M, t7 Z! q2 I: d
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4条精彩回复,最后回复于 2016-4-1 10:57

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whh676  博士二年级 发表于 2016-1-10 19:47:45 | 显示全部楼层 来自: 山西晋中
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草船借箭  硕士三年级 发表于 2016-1-10 19:50:57 | 显示全部楼层 来自: 山东烟台
whh676 发表于 2016-1-10 19:47
, h7 X' i# O  C5 x感谢版主信息分享!版主知道我们国内最先进的检测手段和检测机构有哪些吗?不穿刺、不微创、最好抽血检测的 ...
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广州金域你可以了解下
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[LV.10]至尊爱粉
whh676  博士二年级 发表于 2016-1-10 20:03:53 | 显示全部楼层 来自: 山西晋中
草船借箭 发表于 2016-1-10 19:50
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1 b  h9 q0 W- S- ~  H0 w# w
好的,感谢版主回复!
abcdef123  禁止访问 发表于 2016-4-1 10:57:16 | 显示全部楼层 来自: 河北保定
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